Emperor's Clothes

Τα ρούχα του βασιλιά

Αποσαφήνιση των στοιχείων σχετικά με τις ταχείες δοκιμές αντιγόνου SARS-CoV-2 στις πολιτικές δημόσιας υγείας στο COVID-19

Share:

Η χρήση της δοκιμής αντιγόνου ταχείας πλευρικής ροής (LFT) για το SARS-CoV-2 αμφισβητήθηκε με ανακριβείς αναφορές κακής ευαισθησίας στο LFT. Η συζήτηση σχετικά με τη χρήση της δοκιμής αντιγόνου Innova Lateral Flow SARS-CoV-2 στο Ηνωμένο Βασίλειο κινδυνεύει να προκαλέσει σύγχυση στους υπεύθυνους χάραξης πολιτικής διεθνώς και ενδεχομένως να καθυστερήσει την ανάπτυξη LFT σε άλλες χώρες.
Καθώς οι επιστήμονες και οι επαγγελματίες υγείας αξιολογούν μερικούς από τους μεγαλύτερους πιλότους του LFT στον κόσμο, θέλουμε να αμφισβητήσουμε αυτές τις ερμηνείες και να διευκρινίσουμε τα στοιχεία σχετικά με το πώς τέτοιες δοκιμές θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν για την ανίχνευση του SARS-CoV-2 σε λίγα λεπτά και τη βελτίωση των μέτρων ελέγχου του COVID-19.
Ο έλεγχος για το SARS-CoV-2 είναι κεντρικός για τη διαχείριση του COVID-19 και βασίστηκε στην τεχνολογία ποσοτικής αντίδρασης πολυμεράσης ανάστροφης μεταγραφάσης (PCR). Το PCR αναζητά τον γενετικό κώδικα του ιού από επιχρίσματα μύτης ή λαιμού και τον ενισχύει σε περισσότερους από 30-40 κύκλους, διπλασιάζοντας κάθε κύκλο, επιτρέποντας την ανίχνευση ακόμη και μικροσκοπικών, δυνητικά μονών, αντιγράφων. Η PCR είναι επομένως μια ισχυρή κλινική δοκιμή, ειδικά όταν ένας ασθενής μολύνθηκε, ή πρόσφατα, με SARS-CoV-2. Τα θραύσματα του RNA μπορούν να παραμείνουν για εβδομάδες μετά την εκκαθάριση του μολυσματικού ιού, συχνά σε άτομα χωρίς συμπτώματα ή γνωστές εκθέσεις.
Ωστόσο, για μέτρα δημόσιας υγείας, απαιτείται άλλη προσέγγιση. Οι δοκιμές για να επιβραδυνθεί η εξάπλωση του SARS-CoV-2 δεν ρωτούν αν κάποιος έχει RNA στη μύτη του από προηγούμενη λοίμωξη, αλλά αν είναι μολυσματικός σήμερα. Είναι καθαρή απώλεια για την υγεία, την κοινωνική και την οικονομική ευημερία των κοινοτήτων, εάν τα άτομα μετά τη μόλυνση δοκιμάσουν θετικά και απομονωθούν για 10 ημέρες. Κατά την άποψή μας, οι τρέχουσες δοκιμές PCR δεν είναι επομένως το κατάλληλο χρυσό πρότυπο για την αξιολόγηση ενός τεστ δημόσιας υγείας SARS-CoV-2.
Τα περισσότερα άτομα που έχουν μολυνθεί με SARS-CoV-2 είναι μεταδοτικά για 4-8 ημέρες.
Γενικά, τα δείγματα δεν βρέθηκαν να περιέχουν θετικό στην καλλιέργεια (δυνητικά μεταδοτικό) ιό μετά την 9η ημέρα μετά την έναρξη των συμπτωμάτων, με το μεγαλύτερο μέρος της μετάδοσης να συμβαίνει πριν από την 5η ημέρα.
Αυτό το χρονοδιάγραμμα ταιριάζει με τα παρατηρούμενα πρότυπα μετάδοσης ιών (συνήθως 2 ημέρες πριν από 5 ημέρες μετά την έναρξη των συμπτωμάτων), γεγονός που οδήγησε τους οργανισμούς δημόσιας υγείας να συστήσουν μια περίοδο απομόνωσης 10 ημερών.
Το σύντομο παράθυρο μεταδοτικότητας έρχεται σε αντίθεση με μια διάμεση θετικότητα PCR 22-33 ημερών (μεγαλύτερη με σοβαρές λοιμώξεις και κάπως μικρότερη μεταξύ ασυμπτωματικών ατόμων).
Αυτό υποδηλώνει ότι το 50-75% του χρόνου που ένα άτομο είναι θετικό στην PCR, είναι πιθανό να είναι μετα-μολυσματικό.
Μόλις ελεγχθεί η αντιγραφή SARS-CoV-2 από το ανοσοποιητικό σύστημα, τα επίπεδα RNA που ανιχνεύονται από PCR σε αναπνευστικές εκκρίσεις πέφτουν σε πολύ χαμηλά επίπεδα όταν τα άτομα είναι πολύ λιγότερο πιθανό να μολύνουν άλλους.
Τα υπόλοιπα αντίγραφα RNA μπορεί να διαρκέσουν εβδομάδες ή περιστασιακά μήνες,
για εκκαθάριση, κατά την οποία το PCR παραμένει θετικό.
Μια δοκιμή δημόσιας υγείας για την ανίχνευση κάποιου που μπορεί να μεταδοθεί, με λογική αφαίρεση, αναμένεται να έχει ευαισθησία περίπου 30-40% έναντι της PCR κατά τη δοκιμή ενός τυχαίου δείγματος ασυμπτωματικών ατόμων σε ένα ξέσπασμα σταθερής κατάστασης.
Επιπλέον, η ασυμμετρία του RNA που αντικατοπτρίζει περισσότερη μολυσματικότητα πλησιέστερα στον χρόνο έκθεσης, σημαίνει ότι η ευαισθησία του ιδανικού τεστ μολυσματικότητας όταν μετριέται έναντι της PCR μπορεί να ποικίλλει σε όλη την καμπύλη επιδημίας, από το 50 έως 60% όταν αυξάνεται μια εστία σε 20-30% ή λιγότερο καθώς οι λοιμώξεις μειώνονται.
Το πρόγραμμα δοκιμών LFT και του Ηνωμένου Βασιλείου έχουν επικριθεί για κακή ευαισθησία σε άτομα χωρίς συμπτώματα. Κατά την άποψή μας, αυτές οι επικρίσεις παρερμήνευσαν δεδομένα από την ενδιάμεση έκθεση σχετικά με τον πιλότο κοινοτικών δοκιμών στο Λίβερπουλ του Ηνωμένου Βασιλείου. Όταν πραγματοποιήθηκε δοκιμή ζευγών LFT και PCR στο Λίβερπουλ, η καμπύλη επιδημίας μειώθηκε.
Σε αυτό το σημείο, a priori θα πρέπει να περιμένει μια δοκιμή δημόσιας υγείας που να είναι πολύ ευαίσθητη για την ανίχνευση μολυσματικού ιού για να δείξει χαμηλή συνολική ευαισθησία σε σχέση με την PCR σε άτομα χωρίς συμπτώματα ή γνωστές εκθέσεις.
Περαιτέρω σύγχυση βασίζεται σε τιμές κατωφλίου κύκλου PCR (Ct), ιικά φορτία και μολυσματικότητα. Στον πιλότο του Λίβερπουλ, η Innova LFT πήρε 19 από 24 (79%) δείγματα με Ct κάτω από 20 και δέκα από τα 11 (91%) δείγματα με Ct κάτω από 18. Η ευαισθησία 66% στην ενδιάμεση έκθεση του Λίβερπουλ βασίστηκε προσεκτικά στο Ct παρακάτω ή ίσο με 25 που δείχνει βιώσιμο ιό. Για την εργαστηριακή επεξεργασία των δειγμάτων του Λίβερπουλ, οι τιμές Ct 21–18 αντικατοπτρίζουν κατά πάσα πιθανότητα τα 100.000 έως 1 εκατομμύριο αντίγραφα RNA ανά mL, ποσότητες κάτω από τις οποίες οι καλλιέργειες ιών συνήθως γίνονται αρνητικές και οι κίνδυνοι μετάδοσης είναι χαμηλοί.
Άλλα εργαστήρια τοποθετούν αυτό το όριο σε Ct 30. Δεν υπάρχει διεθνής τυποποίηση μεταξύ εργαστηρίων και προσδιορισμών, αφήνοντας τη βαθμονόμηση Ct με ιικό φορτίο να μην αναφέρεται καλά και να παρανοείται εύκολα.
Τα πρώτα ευρήματα, που αναφέρθηκαν ευρέως, από μια μελέτη του Ferguson και των συναδέλφων τους, έδειξαν ότι το LFT είχε μόνο 3% ευαισθησία για την ανίχνευση του SARS-CoV-2 μεταξύ των θετικών σε PCR φοιτητών στο Πανεπιστήμιο του Μπέρμιγχαμ. Η υποαπόδοση του τεστ υπονοήθηκε για να εξηγήσει την εύρεση δύο μόνο θετικών αποτελεσμάτων μεταξύ 7189 ατόμων που δοκιμάστηκαν με Innova LFT. Σε αυτή τη μελέτη, σε ένα τυχαίο δείγμα 710 (10%) LFT-αρνητικών ατόμων, υπήρχαν έξι θετικά PCR αποτελέσματα. Το συμπέρασμα αυτό προέκυψε σε 60 περιπτώσεις σε ολόκληρη την κοόρτη, δίνοντας μια παρέκταση ευαισθησία δύο από τις 62 (3,2%). Οι τιμές Ct από τα έξι PCR θετικά δείγματα προβάλλονται σε τιμές Ct για τις 60 περιπτώσεις (54 μη παρατηρημένες συν έξι παρατηρήθηκαν). Και στις έξι περιπτώσεις που παρατηρήθηκαν, τα ιικά φορτία ήταν πολύ χαμηλά (Ct ≥29 που αντικατοπτρίζουν περίπου <1000 αντίγραφα RNA ανά mL στο εργαστήριο που χρησιμοποιήθηκε) – όταν το LFT θα έπρεπε να είναι αρνητικό. Συγκριτικά, ο πιλότος του Λίβερπουλ είδε επίπεδα ιών 1000 έως 1 εκατομμύριο φορές υψηλότερα.
Κατά την άποψή μας, η μελέτη του Μπέρμιγχαμ έδειξε ότι οι ασυμπτωματικοί μαθητές με θετική PCR σε μια περίοδο πτώσης της συχνότητας εμφάνισης COVID-19 είχαν χαμηλά ιικά φορτία σε σύγκριση με τα συμπτωματικά μέλη του κοινού που παρακολούθησαν κέντρα δοκιμών και ότι η LFT λειτουργούσε όπως αναμενόταν.
Υποστηρίζουμε ολόψυχα μια υγιή επιστημονική συζήτηση για την άμεση ενημέρωση των πολιτικών. Ο δρόμος COVID-19 μπροστά φαίνεται προκλητικός. Επομένως, χρειαζόμαστε μεγάλες, τολμηρές δράσεις σε όλη την επιστήμη και την κοινωνία, όπως ο πιλότος δοκιμών της κοινότητας του Λίβερπουλ. Οι άμεσες αποδείξεις από αυτούς τους πιλότους μπορούν να ενημερώσουν τις πολιτικές και να διατηρήσουν την εμπιστοσύνη του κοινού στις αντιδράσεις δημόσιας υγείας που απαιτούνται για την πλοήγηση στην πορεία αυτής της πανδημίας.

Οι IEB, MG-F και MGS έλαβαν επιχορήγηση από το Υπουργείο Υγείας και Κοινωνικής Φροντίδας του Ηνωμένου Βασιλείου για την αξιολόγηση της LFT στον πιλότο του Λίβερπουλ που συζητείται σε αυτό το σχόλιο. Το IEB αναφέρει αμοιβές από την AstraZeneca ως επικεφαλής σύμβουλος επιστημόνων δεδομένων μέσω του Πανεπιστημίου του Λίβερπουλ και επιχορήγηση ανώτερου ερευνητή από το Εθνικό Ινστιτούτο Έρευνας Υγείας (NIHR) εκτός του υποβληθέντος έργου. Η MGS είναι πρόεδρος του επιστημονικού συμβουλευτικού συμβουλίου της μολυσματικής νόσου και μέτοχος μειοψηφίας στην Integrum Scientific LLC, Greensboro, NC, USA, μια εταιρεία που έχει συμφέροντα στη δοκιμή COVID-19 αλλά όχι με τεχνολογία πλευρικής ροής και αναφέρει επιχορηγήσεις από το NIHR, το Συμβούλιο Ιατρικής Έρευνας και η Ερευνητική Μονάδα Προστασίας της Υγείας σε Αναδυόμενες και Ζωονοτικές Λοιμώξεις, Πανεπιστήμιο του Λίβερπουλ. Η MJM αναφέρει χρηματοδότηση της έρευνας από το Βραβείο Πρόωρης Ανεξαρτησίας του Διευθυντή Υγείας των ΗΠΑ για τα Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας DP5-OD028145 και από το Open Philanthropy and Good Ventures. Το TEP υποστηρίζεται από την NIHR Health Protection Research Unit in Healthcare Associated Infections and Antimicrobial Resistance στο Πανεπιστήμιο της Οξφόρδης σε συνεργασία με τη Δημόσια Υγεία Αγγλία (PHE), το NIHR Biomedical Research Center, Oxford, και συνεργάστηκε με το PHE Porton για την επικύρωση του LFT.

(https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(21)00425-6/fulltext)

Previous Article

H Moderna ανακάλυψε το εμβόλιο για το COVID πριν το …COVID;;;!!!

Next Article

Δρ Robert Malone, εφευρέτης των εμβολίων mRNA, για την βιοηθική στα πειραματικά εμβόλια

Σχετικά Άρθρα